口腔医学研究

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:42-1682/R

国际刊号:1671-7651

口腔医学研究杂志2022年第8期:高通量测序技术筛选口腔扁平苔藓患者组织中microRNAs的差异表达谱及分析

发布日期:

作者:刘健, 李天翠, 吴景景, 姚曼曼, 许彦枝, 李京哲

单位:河北医科大学第四医院口腔科 河北 石家庄 050011

关键词:口腔扁平苔藓,高通量测序,微小RNA,生物信息学分析,

基金:2018 老年病防治项目(编号:361006)中国癌症基金会北京希望马拉松专项基金(编号:NCC2017A25)2019政府资助临床医学优秀人才培养项目

目的: 通过高通量测序筛选口腔扁平苔藓(oral lichen planus, OLP)患者和正常人口腔黏膜组织中差异表达的微小RNA(miRNAs),探讨miRNAs在OLP发病机制中的作用。方法: 收集3例就诊于河北医科大学第四医院口腔科的OLP患者病变组织(P组)和3例正常口腔黏膜组织(N组),进行illumina高通量测序,筛选差异表达的miRNAs,利用生物信息学分析对差异最显著的6个miRNA进行靶基因预测和功能富集分析。结果: 应用DESeq软件,筛选出两组间差异表达的miRNAs共61个(|log2FoldChange| > 1,P<0.05),其中表达上调的23个,下调的38个。选择上调(miR-449c-5p、miR-663b和miR-196a-5p)和下调(miR-133b、miR-1-3p和miR-133a-3p)最显著的miRNA各3个进行靶基因预测,GO分析显示这些靶基因主要富集在细胞膜区域,可能参与了细胞迁移、分化、代谢和分泌调节等生物过程,KEGG分析显示这些靶基因显著富集在MAPK、Rap1、NF-κB、Ras等信号通路上。结论: OLP和正常口腔黏膜之间存在差异表达的miRNA,这些miRNA可通过SEMA3F、HECW1、POLDIP等靶基因作用于MAPK、NF-κB、Rap1等通路,参与OLP的发生发展。

来源:2022年第8期

《口腔医学研究》期刊编辑部

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