国内刊号:42-1682/R
国际刊号:1671-7651
发布日期:
作者:李姗姗, 孙雁斐, 郭艺, 杨芳
单位:1.青岛大学口腔医学院 山东 青岛 266003;2.同济大学嵌入式系统与服务计算教育部重点实验室 上海 200092;3.青岛市市立医院口腔医学中心 山东 青岛 266071
关键词:单细胞拉曼,口腔病原微生物,鉴定,随机森林,主成分分析,
目的: 评价单细胞拉曼技术对3种口腔病原微生物的快速分类效能。方法: (1)培养变异链球菌UA159、白色念珠菌ATCC10231和粪肠球菌ATCC29212至稳定期,绘制生长曲线评估生长状态;(2)测量对数和稳定期菌株单细胞拉曼图谱,使用主成分和随机森林分析方法分析光谱。结果: (1)3个菌株的对数期和稳定期均可被拉曼技术快速区分。准确率分别为:99.6%、99.86%、99.60%;(2)单细胞拉曼技术能够快速精确区分稳定期的3种实验菌株,准确率高达99.68%;(3)通过随机森林算法分析得到3种稳定期实验菌株之间的拉曼差异峰分别为:1126~1128 cm-1、736~744 cm-1、1330~1440 cm-1、778~785 cm-1、1001~1003 cm-1和1431~1481 cm-1。其生物学标志分别为:蛋白质、胸腺嘧啶、脂质、胞嘧啶、尿嘧啶、苯丙氨酸、蛋白质。结论: 单细胞拉曼光谱可高效区分物种的生长时期和菌株类别。
来源:2021年第9期
《口腔医学研究》期刊编辑部